V srpnu roku 1990 byl spuštěn provoz druhého tábora nazvaného KOMÁŘÍ PASEKA. Jedná se o louku, která se nachází asi 2 km od Komáří louky a která leží u obce Mutyněves, v bezprostřední blízkosti stejnojmenného rybníka a která také píše svoji vlastní historii.

Také Komáří paseka, stejně jako Komáří louka, hostila za dobu své existence stovky mladých lidí. Převážně se však jednalo o zálesáky v zelené kategorii, tedy děti od 10 do 15 let.

Komáří paseka byla vybudována podle vzoru Komáří louky a dodnes slouží jako tradiční základna zálesáckého tábora. Její zařízení tvoří stany na dřevěných podsadách, dřevěná jídelna s letní kuchyní a jednoduché sociální zařízení.

Na Komáří pasece se zálesácké tábory pořádají i v současné době. Jelikož však již nemá takovou vytíženost jako dřív, je také komerčně pronajímána.